Une plateforme de calcul hybride basée sur la NVIDIA QODA (Quantum Optimized Device Architecture).
Qubit Pharmaceuticals, qui se définit comme une “société deeptech spécialisée dans la simulation et la modélisation moléculaire grâce à l’utilisation de la physique quantique”, annonce la création d’une plateforme visant à accélérer la découverte de médicaments par calcul hybride, classique et quantique basée sur la NVIDIA Quantum Optimized Device Architecture (QODA).
Qubit Pharmaceuticals rapporte “exploiter l’un des supers ordinateurs GPU les plus puissants en France dédié à la recherche médicale avec pour objectif de construire un portefeuille de candidats médicaments dans les domaines de l’oncologie, des maladies inflammatoires et des antiviraux”. La société précise que les premiers candidats-médicaments, issus de la collaboration avec NVIDIA, devraient être testés par des laboratoires pharmaceutiques dès 2023. Dans l’immédiat, la nouvelle plateforme vise à développer 10 programmes internes de recherche dans les domaines de l’oncologie, des maladies inflammatoires et des antiviraux.
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Un million de milliards d’opérations par seconde
Qubit Pharmaceuticals explique :
“La recherche de médicaments par simulation et modélisation nécessite des capacités de calcul inédites dépassant le pétaflop, soit plus d’un million de milliards d’opérations par seconde. La nouvelle plateforme combine la suite logicielle Atlas de Qubit et la puissance de calcul de NVIDIA.
En créant des jumeaux numériques des molécules physiques, la plateforme Atlas de Qubit accélère les calculs d’un facteur 100.000, réalisant en quelques heures des calculs qui nécessitent plusieurs années par des voies conventionnelles. Alors qu’une recherche classique nécessite typiquement 5 000 synthèses moléculaires, la simulation réduit ce nombre à environ 200. La simulation permet également d’explorer en parallèle plusieurs familles chimiques, plutôt qu’en séquentiel.”
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Jeter les bases de la simulation par calcul quantique
La nouvelle plateforme est accélérée par 200 GPU (cartes graphiques de dernière génération) dont les systèmes DGX A100 de NVIDIA. D’après l’entreprise, “l’association de la plateforme de calcul accélérée de NVIDIA et du logiciel Atlas de Qubit vise à diviser par plus de 2 le temps nécessaire pour cribler, sélectionner un candidat médicament d’intérêt et l’optimiser ; par plus de 10 les investissements nécessaires”.
Concernant l’aspect informatique quantique, le communiqué de Qubit Pharmaceuticals stipule :
“L’avenir de la modélisation et de la simulation moléculaires dans la découverte de médicaments devrait résider dans l’utilisation hybride de super-ordinateurs classiques et d’ordinateurs quantiques. Les ordinateurs quantiques servent d’accélérateurs pour certains calculs clés aux côtés des supercalculateurs GPU. Pour explorer ce nouveau domaine de recherche, Qubit a choisi NVIDIA QODA, une plate-forme de calcul hybride quantique-classique. QODA permet l’intégration transparente de l’informatique quantique avec le supercalculateur accéléré par GPU, et est compatible avec toutes les ressources quantiques, y compris les QPU physiques et l’émulation avec cuQuantum.
La collaboration entre NVIDIA et Qubit Pharmaceuticals jette les bases de la simulation informatique quantique et de la modélisation moléculaire pour la découverte de médicaments, et contribuera à créer les architectures informatiques qui seront utilisées dans les années à venir. Cette coopération vise à ce que les algorithmes soient prêts lorsque les ordinateurs quantiques le seront.”
Déclarations
Robert Marino, Président de Qubit Pharmaceuticals a déclaré : “Nous sommes extrêmement fiers deux années après la création de Qubit d’avoir obtenu la confiance d’un leader mondial tel que NVIDIA. En associant la puissance de calcul de NVIDIA et la capacité de simulation et de modélisation moléculaire de Qubit, nous sommes confiants dans notre capacité à réduire considérablement le temps de développement de nouveaux médicaments et de diviser par dix le coût des développements avant la pré-clinique. Cette collaboration unique au monde est également précurseur dans le domaine de la physique quantique et devrait nous permettre de développer les premiers algorithmes dans ce domaine appliqué à la découverte de médicaments.”
Craig Rhodes, EMEA Industry Lead – AI for Healthcare and Life Science, ajoute : “Accélérer la découverte de médicaments est une priorité majeure pour NVIDIA, et nous développons du software et du hardware spécifiquement pour relever ce défi. Nous avons trouvé de grandes synergies avec Qubit et nous travaillons ensemble pour repousser les frontières de la découverte de médicaments”.
